La Iglesia San Francesco se encuentra en la parte más antigua de Prato y fue construida en el 1282, cuando el municipio donó este terreno a los frailes menores, que construyeron en él un convento y una pequeña iglesia, la primera en el territorio de Prato que se construyó en ladrillo y no en piedra. Sin embargo, la fachada se mantiene en bandas bicolores de alaberes y serpentina, con el añadido en el Renacimiento del elegante portal y el tímpano triangular con el relieve de los Estigmas de San Francisco realizado por Andrea della Robbia.
En el interior, de una sola nave y con cerchas de madera, destaca el púlpito del Siglo XV en pietra serena, sobre el que se encuentra el panel del 1400 del Monograma de Cristo. Sobre el altar se encuentra el Crucifijo de madera policromada del Siglo XIV donado por el comerciante Francesco Datini, cuya lápida de mármol blanco en el suelo de la iglesia lo representa en un elaborado tabernáculo gótico.
El edificio conduce al claustro renacentista y en el lado oriental se encuentra la Capilla del Capitolo, del Siglo XIV, con paredes pintadas al fresco por Niccolò Gerini con historias de San Mateo Apóstol, San Antonio Abad y una Crucifixión. En el lado sur del claustro se encuentra la entrada al convento, que cuenta con hermosas habitaciones de principios del Siglo XIV.
Los cuatro segmentos de la bóveda representan las figuras de los Evangelistas con pinceladas de vivos colores, mientras que la luneta del muro oriental alberga la Crucifixión, la representación más impresionante y, desgraciadamente, también la más deteriorada.
Apodada por los habitantes como la "Capilla de los Scrovegni de Prato", la Capilla de Migliorati es un lugar simbólico de la ciudad de Prato.