Ancien centre d'origine lombarde, Lajatico était autrefois le château des comtes Pannocchieschi, puis de l'évêque de Volterra, avant d'être conquis par la ville de Pise et enfin par la ville de Florence.
Au cours des dernières années, la ville est devenue une destination touristique internationale grâce au ténor Andrea Bocelli, qui y est né et y a construit son célèbre Théâtre du Silence.