Die Gründung der Kartause von Pontignano durch Bindo Falcone, den Enkel des Kardinals Riccardo Petroni, erfolgte um die Mitte des 14. Jahrhunderts im Gebiet von Castelnuovo Berardenga. Von dem ursprünglichen Kloster sind nur wenige Spuren erhalten, da dieses in der zweiten Hälfte des 16. Jahrhunderts infolge eines Brands, der dieses größtenteils zerstörte, komplett neu aufgebaut wurde.
Die Anlage basiert auf einem beinahe rechteckigen Grundriss, der sich nach der traditionellen Kartausen-Ikonografie in drei Abschnitte unterteilt: der erste für die Mönche mit den zwölf Zellen, die um den großen Kreuzgang herum angeordnet sind, der zweite, der aus der Kirche und den Zönobiten-Räumlichkeiten besteht, und der dritte für die Konvertierten.
Die dem Heiligen Petrus geweihte Kirche befindet sich im Zentrum des Klosterkomplexes und ist reich mit Fresken der Geschichten des Heiligen Petrus geschmückt, zu denen auch Fresken des florentinischen Künstlers Bernardino Poccetti gehören. Sehr schön ist der hölzerne Chor an den Wänden mit dem zwölfteiligen Gestühl aus dem Jahr 1590 von Domenico Atticciati.
Heute befindet sich der Klosterkomplex im Besitz der Universität Siena und ist Ort von Studientreffen, Konferenzen und Veranstaltungen verschiedener Art.