Das Naturschutzgebiet Basso Merse umfasst die letzten zehn Kilometer des Flusses Merse, den letzten Abschnitt des Farma und das Gebiet, in dem Merse und Ombrone zusammenfließen. Das Schutzgebiet, das zu den Gemeinden Monticiano, Murlo und Civitella Paganico gehört, wurde eingerichtet, um die Flusslandschaft und ihre Tierwelt zu schützen, zu der Otter und Eisvogel, Wechselkröte und Brillensalamander gehören.
Die Vegetation der Hügel, die bis zu 400 Meter hoch sind, wird von Steineichenwäldern und der typischen Macchia bestimmt, mit einer ganz besonderen Flora an den Stellen, an denen Serpentinit zu Tage tritt, das dunkelgrüne Gestein, das für den Bau zahlreicher Kirchen des Gebiets eingesetzt wurde, einschließlich des Doms von Siena. Dort wachsen typische Pflanzen des mittleren Italien, mit bunten Blüten, die sich im Frühling vor dem dunklen Fels abheben.
Die Lichtungen sind Jagdgebiete für Raubvögel, darunter Schlangenadler, Schwarzmilan, Mäusebussard und Turmfalke. Bei Dämmerung tauchen auch Rehe und Wildschweine auf, die das Schutzgebiet bevölkern.