Il Museo di Storia Naturale del Mediterraneo di Livorno, ospitato all'inerno della storica Villa Henderson, è un centro di ricerca attivo nella salvaguardia e
conservazione del patrimonio naturale ma anche un centro di cultura scientifica e di attività didattiche per le scuole.
La Sala dell'Uomo illustra il tema della evoluzione umana sia dal punto di vista fisico che culturale, con particolare riferimento al popolamento dell'area mediterranea. In un percorso affascinante e facilmente comprensibile sono esposti calchi dei più importanti reperti fossili della famiglia degli ominidi, sono descritte le prove biologiche e paleontologiche del lungo cammino che si ritiene conduca dalle scimmie antropomorfe africane all'uomo moderno e vengono mostrati gli strumenti litici utilizzati nella preistoria. Si può osservare in volto l'Uomo di Neanderthal (riprodotto applicando le tecniche della medicina legale ad un cranio neandertaliano), e ammirare le pitture rupestri in copia della celebre grotta di Lascaux o le statuette delle Veneri preistoriche.
La Sala del Mare è dedicata alla biologia e all'evoluzione dei cetacei, con l'esposizione di scheletri e di fondali marini del Mediterraneo riprodotti attraverso diorami, mentre la Sala degli invetebrati espone esemplari di invertebrati terrestri e marini.
Il percorso comprende anche l'Orto botanico, ricco di esemplari della macchia mediterranea, e il Planetario dotato di una cupola di 5 metri di diametro dove si svolgono lezioni didattiche e un Centro di Educazione Ambientale.